美國(guó)Helicos BioSciences公司研究人員近日稱,他們開(kāi)發(fā)出了一種新型的測(cè)序設(shè)備――單分子DNA測(cè)序儀(single-molecule DNA sequencers)。該儀器能夠“閱讀”單分子DNA的單個(gè)堿基。相關(guān)研究文章發(fā)表在4月4日的《科學(xué)》(Science)上。
傳統(tǒng)上,在測(cè)序之前,要先對(duì)DNA鏈進(jìn)行擴(kuò)增。這一過(guò)程往往會(huì)引入錯(cuò)誤,并且對(duì)某些DNA片斷來(lái)說(shuō)無(wú)法很好地實(shí)現(xiàn),從而使得對(duì)整個(gè)基因組進(jìn)行測(cè)序變得尤為困難。
Helicos BioSciences公司以病毒M13為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,首先將它的基因組截成小的片斷,用一種酶將短小DNA標(biāo)簽附于每個(gè)片斷的末端,在適當(dāng)?shù)奈恢缅^定DNA片斷。之后加入DNA復(fù)制酶和帶有熒光標(biāo)簽的堿基或堿基對(duì)。當(dāng)熒光DNA形成鏈時(shí),就用相機(jī)拍下每個(gè)新加上的堿基對(duì)。
這一新方法稱為“合成測(cè)序”,原則上與其它一些方法相同。不同之處在于,其它一些方法需要同時(shí)測(cè)序數(shù)千個(gè)相同的基因組片斷以使信號(hào)足夠“明亮”,新方法能夠偵測(cè)到單個(gè)堿基的熒光。
新方法避開(kāi)了繁瑣的擴(kuò)增過(guò)程,將能大大降低測(cè)序的時(shí)間和成本。Helicos BioSciences公司估計(jì),新儀器能夠用8周的時(shí)間測(cè)序一個(gè)人的基因組,代價(jià)是7萬(wàn)2000美元,而儀器本身則價(jià)值135萬(wàn)美元。
美國(guó)能源部聯(lián)合基因組研究所主任Edward Rubin說(shuō):“這太酷了!最終,單分子測(cè)序?qū)⒊蔀橥ㄐ械姆椒ā!?br />
新的發(fā)現(xiàn)無(wú)疑又朝著1000美元/人的宏偉基因組測(cè)序計(jì)劃邁近了堅(jiān)實(shí)的一步。論文第一作者Timothy Harris認(rèn)為,這一目標(biāo)將會(huì)在5年以內(nèi)實(shí)現(xiàn)。
(源自:中華機(jī)械網(wǎng))